Департамент науки и инноваций АО «ALT университет Мухамеджана Тынышпаева» оказывает содействие молодым ученым в повышении их профессионального уровня, развитии научного потенциала и реализации их творческих возможностей, представлении защиты и реализации профессиональных, интеллектуальных интересов и прав научной молодежи.

Департамент науки и инноваций организовывает и проводит конкурсы научно-исследовательских работ (проектов) и предметные олимпиады среди обучающихся.

В Университете функционируют совет молодых ученых (СМУ), студенческое научное общество (СНО), студенческие научные кружки (СНК), студенческие конструкторские бюро (СКБ), студенческие научно-исследовательские лаборатории, Технопарк и Бизнес-Инкубатор.